1997年2月，球队接替解散的鸟栖未来，命名为鸟栖沙岩，1998年设立株式会社鸟栖沙岩，Sagan在日语中为沙岩。球队位于九州岛佐贺县鸟栖市，主场为鸟栖球场。1999年当日本乙级联赛成立时，球队成为日乙队伍之一。
　　2011赛季前，鸟栖沙岩一直混迹于日乙联赛，成绩上也无亮点。2011赛季，鸟栖沙岩委任韩国人尹晶焕为主教练，尹晶焕也成为当赛季日本职业足球联赛38支球队(J1及J2)主教练中最年轻的一位。球队在尹晶焕的带领下获得了J2联赛亚军，历史性首次升级到J1联赛。2012赛季，鸟栖沙岩在首个J1联赛中便出色发挥，直至最后1轮球队更是暂居第三，有望获得下赛季亚冠资格，无奈最后一场鸟栖败走横滨，与亚冠参赛资格擦肩而过，但是球队仍历史性取得第五的最佳联赛排名，并且鸟栖当赛季的主场成绩乃联赛第一。